卵巢囊肿属于卵巢肿瘤的一种，部位发生在卵巢，而卵巢又是女性重要的生殖器官，具有产生卵子、排卵、分泌雌孕激素的生理功能，所以卵巢部位长了囊肿肯定会在一定程度上影响卵巢的生理功能。若囊肿的体积较小，小于1cm，一般情况下不会对卵巢产生卵子及排卵产生影响，所以一般情况下不会对生育产生什么影响。若卵巢囊肿为1-2个，体积不大，一般情况下也不会影响生育，但若卵巢囊肿数量较多，可能会对卵巢的排卵产生影响，导致卵子的质量下降，或者甚至导致卵巢无法排卵，自然就无法怀孕。卵巢囊肿有一定的恶变倾向，所以若囊肿发生恶变则会影响生育功能。
卵巢囊肿能否怀孕与囊肿的情况有关，对于小的囊肿定期观察，对于大的囊肿及时切除，以免以后影响生育。